まあ、色々あるようですが。
わたしはあんまり携帯動画とかは興味ないので普通にAVIとかMPEGとかに変換できるツールを探しました。
Freez Flv to AVI/MPEG/WMV Converter
↑ オススメ
Free iPod Video Converter, 3GP Video Converter, DVD Ripper, Video Capture, Flv Converter.
このページからどうぞ。
右下の方にあります。
っていうか、携帯動画用の変換ツールなんかも同じページで配布されております。